【类型】期刊

【题名】利用水稻MAGIC群体关联定位抽穗期和株高QTL

【基金项目】国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2014aa10a601)；农业部引进国际先进农业科学技术计划(948计划)项目(2016-x16)；深圳孔雀团队计划(20130415095710361)；中国农业科学院科技创新工程团队项目资助

【作者】 申聪聪，朱亚军，陈凯，陈慧珍，吴志超，孟丽君，徐建龙

【关键词】 株高 抽穗期 QTL MAGIC群体 关联分析 水稻

【摘要】利用多亲本高代互交系(multi-parent advanced generation inter-cross,MAGIC)群体(DC1、DC2和8way)及其复合群体DC12(DC1+DC2)和RMPRIL(DC1+DC2+8way)进行关联分析定位水稻抽穗期和株高QTL。2015年和2016年分别在江西和深圳收集3个MAGIC群体抽穗期数据,2016年在两地收集株高数据,结合Rice 55K SNP芯片进行基因分型,利用关联分析方法检测到3个影响抽穗期的主效QTL(q HD3、q HD6和q HD8),分别位于第3、第6和第8染色体,且分别与已知抽穗期基因DTH3、Hd3a和Ghd8在同一区域。检测到5个影响株高的QTL(q PH1.1、q PH1.2、q PH1.3、q PH4和q PH6),其中q PH1.1和q PH1.2位于已知基因Psd1和sd1附近,其余3个QTL为影响株高的新位点,但仅在1个群体和单个环境下被检测到,QTL表达受遗传背景和环境影响大。不同MAGIC群体定位抽穗期和株高的效果不同,在8亲本MAGIC群体8way及复合群体DC12和RMPRIL分别检测到5、5和6个抽穗期和株高QTL,明显多于4亲本群体DC1的2个和DC2的4个,而且作图的精度更高,表现在定位到的QTL显著水平高和与已知基因距离更近,尤其是复合群体的联合分析(如DC12和RMPRIL)的作图优势更为明显。

【年份】2020

【页码】1611-1621

【期号】第11期

【作者单位】中国农业科学院作物科学研究所；中国农业科学院农业基因组研究所；江西省萍乡市农业科学研究所；中国农业科学院深圳生物育种创新研究院

【期刊卷】第43卷

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