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天然三倍体鲫鱼突变体萍乡肉红鲫线粒体细胞色素b基因序列分析
作者: 付小全,曾柳根,洪一江,盛军庆,王军花,桂建芳   来源: 暂无 日期: 暂无 文献类型: 期刊 关键词: b基因  萍乡肉红鲫  序列分析  线粒体  Cyt  描述: 用细胞色素b(Cyt b)基因特异性引物,对萍乡肉红鲫(Carassius auratus var.pingxiangnensis)的线粒体Cytb基因进行PCR扩增和双向测序。在12个个体中均得到序列一致的Cytb基因全序列,长度为1 140 bp。其A、T、G、C含量分别为28.2%(321)、28.8%(328)、14.8%(170)和28.2%(321),A+T含量(57%)明显高于G+C含量(43%),与其他水生动物相同基因片段碱基含量相似。该基因中密码子第1位核苷酸中4种碱基组成较为均衡;第2位核苷酸中T的使用率较高,为41.8%,G的使用率较低,为13.2%;密码子第3位A的使用率较高,为39.7%,而G的使用率较低,仅为6.3%。BLAST结果显示,萍乡肉红鲫与其他鲫鱼类的Cytb基因具有较高的同源性,其中与银鲫(C.a.gibelio)的相似性为93%,与普通鲫鱼(C.carassius)的相似性为98%。邻接法构建的分子系统进化树表明,萍乡肉红鲫与普通鲫鱼亲缘关系最近。
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